Universally primed polymerase chain reaction analysis of Fusarium avenaceum isolated from wheat and barley in Finland

Suomalaisia vehnästä ja ohrasta eristettyjä punahomekantoja (Fusarium avenaceum) tutkittiin UP-PCR (Universally Primed Polymerase Chain Reaction) -menetelmällä. F. avenaceum -kannat voitiin jakaa erilaisilla feneettisillä ja fylogeneettisillä tietokoneohjelmilla kahteen pääryhmään, jotka vielä jakautuivat useaan alaryhmään. Fylogeneettisten ryhmien ja kantojen maantieteellisen jakauman välillä ei voitu havaita selvää riippuvuutta. Kannat erosivat toisistaan patogeenisuustesteissä, mutta samat ohrasta ja vehnästä eristetyt isolaatit olivat patogeenisimpiä sekä vehnällä että ohralla. Tulosten perusteella vaikuttaa siltä, että F. avenaceum, jonka tiedetään olevan suhteellisen heikko patogeeni viljakasveilla, ei ilmeisesti ole erikoistunut kumpaankaan isäntäkasviin.