Mapping antigenic epitopes of potato virus Y with antibodies affinity-purified by using overlapping synthetic peptides

Työssä syntetisoitiin limittäisten heksapeptidien sarja, joka kattoi perunavirus Y:n (PVY) kapsidiproteiinin koko aminohapposekvenssin. Peptidien avulla affiniteettipuhdistettiin anti-PVY vasta-aineita polyklonaalisista anti-PVY antiseerumeista, ja vasta-aineiden sitoutuminen PVY- partikkeleihin tutkittiin entsyymi-immunoassaymenetelmillä. Näin saatiin identifioitua PVY:N kapsidiproteiinin antigeenisia alueita, joita löydettiin erityisesti kapsidiproteiinin polypeptidiketjun päistä. Vertailu menetelmään, jossa mitattiin anti-PVY-vasta-aineiden sitoutumista ko. peptidisarjan peptideihin, paljasti useita eroavaisuuksia. Tulokset osoittavat, että luotettavan epitooppikartan saamiseksi on tutkittava sekä vasta-aineiden sitoutumista peptideihin että peptideistä eluoitujen vasta-aineiden sitoutumista virusantigeeniin. Saadut tutkimustulokset auttavat synteettisiin peptideihin perustuvien määritysmenetelmien kehittämisessä kasviviruksille.