A linkage map of spring turnip rape based on RFLP and RAPD markers

Abstract

Rypsin kytkentäkartan laatimista varten kasvatettiin F2- populaatio, jonka vanhempina olivat yksilöt kevätrypsilinjoista Jo4002 ja Sv3402. DNA-polymorfia oli runsasta tässä karttapopulaatiossa: testatuista 81 RFLP-probista 67 % ja testatuista 340 RAPD-primerista 79 % oli polymorfisia risteytysvanhemmissa. Lopullinen kartta koostui 168 markkerista, joista 144 oli RAPD-markkereita, 22 RFLP-markkereita, yksi morfologinen markkeri (siemenen väri) ja yksi mikrosatelliitti. Kaikki rypsin 10 kytkentäryhmää pystyttiin tunnistamaan, ja kartan kokonaispituus oli 519 cM. Markkereista 13 % ei segregoitunut normaalisti, ja suurin osa näistä markkereista kartoittui vain kahteen kytkentäryhmään. Kartta on ensimmäinen julkaistu rypsin kartta, jossa suurin osa markkereista on RAPDeja. Karttaa on jo aiemmin käytetty hyväksi paikallistettaessa palmitiini- ja öljyhappopitoisuuksiin vaikuttavat geenit, ja tulevaisuudessa sitä käytetään myös muiden tärkeisiin ominaisuuksiin vaikuttavien geenien kartoittamiseen.

A linkage map of spring turnip rape (Brassica rapa ssp. oleifera) was constructed from an F2 population of a cross Jo4002 x Sv3402. The map contained 22 RFLP loci, 144 RAPDs, one microsatellite, and one morphological marker (seed colour). All ten B. rapa linkage groups could be identified and the total map distance was 519 cM. A proportion of the markers (13%), most of which were located in two linkage groups, showed segregation distortion.